Para 1993, la planta de profesores siguió creciendo con la contratación de los siguientes investigadores como profesores adjuntos: Isidoro Gitler (combinatoria y optimización discreta), José Martínez Bernal (geometría algebraica), Víctor Martínez (asintótica cuasiclásica), Tomas E. Gilsdorf (análisis real), Simone Hazan (álgebra universal, órdenes parciales, gráficas, en la Cátedra Lefschetz), Steven Kangas (topología, en la Cátedra Lefschetz), Daniel Hernández (control estocástico), Catherine Searle (geometría diferencial), Piotr N. Zevandrov (asintótica cuasiclásica, propagación de ondas), y de los siguientes como investigadores titulares: Michael Shapiro (variable compleja; visitante), Rodolfo Suárez (teoría del control; visitante en receso sabático), Nikolai Vasilevski (álgebras de operadores, análisis complejo) y Carlos Videla (lógica matemática).
Asimismo, visitaron el Centro 27 investigadores reconocidos internacionalmente, financiados por el Cinvestav y el Conacyt, entre ellos, Vladimir Belov (asintótica cuasiclásica y física-matemática), Manoj Chari (combinatoria y optimización discreta), Adalberto García-Máynez (topología), Martin Guest (topología y geometría diferencial),Wieslaw Krolikovski (análisis hipercomplejo, análisis cuaterniónico), Arturo Kohatsu (procesos estocásticos), Jean B. Lasserre (control estocástico y optimización), Julián Lawrynowicz (análisis hipercomplejo), Wolfgang Runggaldier (control estocástico), Joseph Varilly (simetrías canónicas y esquemas de cuantización geométrica), Josef Zajac (transformación cuasiconforme) y Mario Zuluaga (análisis no lineal).
Durante el periodo 1990 a 1993 se publicaron alrededor de 53 artículos de investigación en diversas revistas de prestigio internacional. Asimismo, 20 estudiantes obtuvieron el grado de maestro en ciencias y seis el grado de doctor en ciencias.
En 1994, llegaron 11 profesores visitantes, entre ellos, Vladimir Belov (asintótica cuasiclásica y física-matemática), Rolando Cavazos (procesos de decisión markovianos), Sergei Yu Dobrokhotov (asintótica cuasiclásica), Emmanuel Fernández-Guacherand (control estocástico), Arturo Kohatsu (procesos estocásticos) y John Ryan (análisis de Clifford). Durante ese año se publicaron alrededor de 15 artículos de investigación en diversas revistas de prestigio internacional, cinco artículos de divulgación y dos libros de investigación. Asimismo, cinco estudiantes obtuvieron el grado de maestro en ciencias.
Para ese tiempo, las instalaciones del Departamento ya resultaban insuficientes para albergar a todos sus integrantes, por lo que se planteó ampliar el edificio y se intentó resolver provisionalmente el problema de espacio alquilando una casa en la colonia Lindavista para que los alumnos tuvieran un lugar para estudiar. Sin embargo, esta solución no resultó, por lo que se empezaron a construir en los terrenos de Zacatenco unas "casetas" (más bien "galpones") destinadas a algunos de los Departamentos con problemas de espacio. Sin embargo, dificultades con la empresa constructora retrasaron de tal forma su terminación que el Departamento nunca llegó a utilizarlas. Mientras tanto, gracias a la realización un "macroproyecto" se construyeron varios edificios, uno de los cuales ocuparía el Departamento de Matemáticas, también después de varios años por problemas con las compañías constructoras.
En 1995 varios investigadores de reconocido prestigio internacional visitaron el Departamento, por ejemplo: André Bouchet (delta matroides y gráficas circulares), Benjamín Duran (estadística), Francois Jaeger (teoría combinatoria de nudos y teoría de gráficas), Vladimir V. Kisil (análisis complejo y teoría de operadores), Ludger Overbeck (probabilidad), Edouard Wagneur (sistemas de eventos discretos). Como investigador de la Cátedra Lefschetz estuvo Piotr Rybka (ecuaciones diferenciales parciales).
En este año, Luis G. Gorostiza organizó la sesión especial sobre Procesos Estocásticos dentro del II Joint Meeting AMS-SMM, que se celebró en la ciudad de Guanajuato, y Enrique Ramírez de Arellano la sesión especial sobre Análisis Complejo y Teoría de Operadores en el mismo encuentro. Ocho estudiantes obtuvieron el grado de maestro en ciencias.
En 1996 se unió a la planta de profesores como visitante Valeri Kucherenko (ecuaciones diferenciales parciales, métodos asintóticos). Durante este año, varios investigadores participaron en la organización de diversas actividades para celebrar el 35° aniversario del Cinvestav; por mencionar algunos, Isidoro Gitler y José Martínez Bernal, el Taller de Investigación sobre Aspectos Combinatorios y Computacionales de Optimización, Topología y Álgebra (ACCOTA'96); Jesús González, el Taller de Topología Algebraica; Luis G. Gorostiza, el IV simposio de Probabilidad y Procesos Estocásticos; Onésimo Hernández-Lerma, el Taller sobre Control Estocástico; Enrique Ramírez de Arellano y Nikolai Vasilevski, el International Symposium on Complex Analysis and Related Topics y el Seminario Interinstitucional de Análisis: Norte-Sur. A estas actividades asistieron más de 150 investigadores de prestigio internacional.
En este mismo año, profesores y estudiantes del Departamento iniciaron la publicación de la revista Morfismos. Comunicaciones Estudiantiles del Departamento de Matemáticas. Su objetivo es lograr que los estudiantes, tanto del Cinvestav como de otras instituciones nacionales e internacionales, adquieran experiencia en la escritura de resultados matemáticos. En la revista se publican reportes de investigación matemática o resúmenes de tesis de licenciatura, maestría o doctorado, así como artículos originales en los resultados o en los métodos. El consejo editorial está integrado por al menos dos estudiantes de doctorado y cuatro profesores del Departamento. Asimismo, Tomasz Bojdecki (procesos estocásticos), André Bouchet (multimatroides), Wieslaw Królikovski (análisis de Clifford), Mario Zuluaga (ecuaciones parciales elípticas no lineales) llegaron a la institución como investigadores visitantes.
Durante este año comenzó la revisión de los planes de estudio y, como consecuencia de ello, se modificaron los programas de los cursos básicos y se planteó la necesidad de ampliar la gama de temas que se cultivan en el Departamento hacia áreas aplicadas. En particular, se elaboró una propuesta para establecer una opción dentro del programa de maestría que incluyera, por ejemplo, temas de computación, optimización, control y matemáticas financieras. Después de una revisión exhaustiva, finalmente el Consejo Académico Consultivo del Cinvestav aprobó la opción en matemáticas computacionales.
Se publicaron alrededor de 23 artículos de investigación en revistas internacionales, seis artículos en extenso en memorias de congresos, un libro en la editorial Springer, de Nueva York. Siete estudiantes obtuvieron el grado de maestro en ciencias y uno el de doctor en ciencias, en la especialidad de matemáticas.
En 1997, después de un retraso de varios años, finalmente el Departamento pudo mudarse a un nuevo edificio, más amplio que el anterior. Mordechai Katzman (álgebra conmutativa) ocupó la Cátedra Lefschetz. Roberto Quezada, Raúl Quiroga (geometría diferencial), Ekaterina Todorova (probabilidad y procesos estocásticos), Ernesto Lupercio y Miguel Xicoténcatl (topología algebraica) se integraron como profesores adjuntos, y José A. López (probabilidad y procesos estocásticos) y Rafael H. Villarreal (álgebra conmutativa y geometría algebraica) ingresaron como profesores titulares.
El Departamento recibió la visita de varios investigadores de diversas instituciones del extranjero, por ejemplo: Luigi Accardi (probabilidad, física-matemática), Lev Aizenberg (diversas variables complejas), Guillermo Ferreyra (sistemas estocásticos); Martin Guest (topología algebraica), James Milgram (topología algebraica), Constantin Tudor (cálculo estocástico en el espacio canónico de Poisson), Michael Wolf (módulos de superficies de Riemann). En este año se implantaron los cursos propedéuticos, con el fin de mejorar el nivel académico y la madurez matemática de los estudiantes que desearan ingresar al programa de maestría.
Se presentaron 16 comunicaciones en congresos internacionales, por mencionar algunos: 103rd Annual Meeting of AMS, Algebraic Topology Conference, Infinite Dimensional Analysis and Quantum Probability, Conference Decision and Control, International Conference on Dynamical Systems y Joint Meeting of Canadian Operator Algebra Symposium, entre otras.
Se publicaron alrededor de 24 artículos de investigación en revistas de reconocimiento internacional. Cinco estudiantes obtuvieron el grado de maestro en ciencias y seis el de doctor en ciencias, en la especialidad de matemáticas.
En 1998, en la Cátedra Lefschetz estuvo Alexey Karapetyants (teoría de operadores y análisis complejo). Además, visitaron el Centro diversos investigadores para colaborar en trabajos de investigación con colegas que pertenecen a la planta de profesores; por hacer mención de algunos: Venkat Anantharam y Jean B. Lasserre (sistemas estocásticos), Alberto Candel (foliaciones locales de autointersección), Boris Mityagin (teoría de operadores), Mijail A. Shubin (variables complejas, análisis en variedades).
Varios miembros de nuestra planta de profesores participaron durante este año en diferentes comités de evaluación, por ejemplo: proyectos del Conacyt, Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica (Chile) y Comisión Dictaminadora del Área 1 del Sistema Nacional de Investigadores, entre otros.
También, algunos investigadores participaron como editores en el Boletín de la Sociedad Matemática Mexicana, la Revista Iberoamericana de Matemáticas, la Applicationes Matemáticas (Academia de Ciencias de Polonia), etc. Nuevamente, se organizó ACCOTA'98, en el cual se reunieron investigadores nacionales y extranjeros de gran prestigio. Asimismo, se obtuvieron ocho apoyos económicos para proyectos de investigación, seis estudiantes obtuvieron el grado de maestro en ciencia y tres el de doctor en ciencias.
En 2000, los investigadores del departamento publicaron 40 artículos de investigación, lo que representa un aumento de 50% respecto del promedio de los años anteriores. En diciembre de 2001 se celebró el Taller Internacional sobre Álgebra, Análisis y Topología Algebraica, con un sustancial apoyo de la National Science Foundation de Estados Unidos.
El Departamento es líder en el desarrollo de las matemáticas en México. Ha logrado la mayor eficacia en el país en la obtención de grados de maestría y doctorado en el área de las matemáticas, así como en la publicación de artículos originales de investigación. Si bien no es el Departamento de matemáticas más grande del país, sí tiene el mayor índice de productividad por investigador entre todas las instituciones dedicadas a las matemáticas en México. Cuenta con una planta académica de 29 investigadores dedicados a diversas ramas: seis en topología algebraica, cinco en análisis, cinco en procesos estocásticos, cuatro en álgebra, cuatro en combinatoria, dos en análisis numérico, dos en geometría diferencial y uno en lógica matemática.
Además, cuenta con 23 estudiantes de maestría y 13 de doctorado. Sus programas de maestría y doctorado están en el padrón de excelencia de Conacyt. Hasta el 2001, se otorgaron 195 grados de maestría y 51 de doctorado. Su biblioteca es una de las mejores que existen en el país en su especialidad; posee casi 15 000 libros y recibe 299 publicaciones periódicas y 58 publicaciones seriadas mediante suscripciones, intercambios y donaciones. Tiene laboratorio de cómputo y acceso a centros de cálculo de otras instituciones nacionales e internacionales.